Евгений Николаевич Зиничев родился 18 августа 1966 года в Ленинграде.

С 1984 по 1986 год служил в Вооруженных силах СССР.

С 1987 по 2015 служил на различных должностях в органах государственной безопасности.

В 2013 году прошел профессиональную переподготовку в Военной академии Генерального штаба Вооруженных сил Российской Федерации.

С 2015 года — начальник Управления ФСБ по Калининградской области.

28 июля 2016 года Указом Президента Российской Федерации назначен временно исполняющим обязанности Губернатора Калининградской области.

Награжден государственными наградами.

Женат.